Všestranné Joy-Cony ponúkajú prekvapivé nové spôsoby hrania hier a zábavy. Oba Joy-Cony sa dajú používať úplne nezávisle od seba. Prípadne ich možno pomocou držiaka Joy-Con spojiť do jedného ovládača. Ako tretiu možnosť možno oba Joy-Cony pripojiť ku konzole a používať ich v režime handheld. Ak chcete hrať spoločne s ostatnými, jednoducho dajte Joy-Con kamarátovi - každý Joy-Con má totiž plný počet tlačidiel a klávesov, a preto sa dá používať ako nezávislý ovládač. Každý Joy-Con má vlastný snímač zrýchlenia a gyroskop, takže všetky pohyby možno vykonávať nezávisle ľavým a pravým Joy-Conom. Okrem toho majú oba Joy-Cony pokročilé HD vibrácie, vďaka ktorým kompatibilné hry ponúkajú oveľa realistickejšie vibrácie ako predtým.